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NIR蛍光染料は、NIR領域（750〜2500nm）での吸収があるため、暗視、不可視材料、レーザー印刷、太陽電池などの分野で広く使用されています。
生物イメージングに使用する場合、近赤外線吸収/発光波長、優れた水溶性、低い生体毒性、特定の組織または細胞への標的化、良好な細胞浸透などを備えています。
代表的なタイプとしては、シアニン染料、BODIPY、ローダミン、クォーボキシル、ポルフィリンなどがあります。